ACD/Labs Percepta Profilers
Vegyületek gyors szűrése és jellemzése fizikai-kémiai, ADME- és toxicitási jellemzői alapján
Az ACD/Labs Percepta Profilers modulok a vegyületek kémiai profiljának gyors és egyszerű meghatározását teszik lehetővé. A magas minőségű tulajdonságbecslő modellek alapján nyert fizikai-kémiai, ADME-, és toxicitási jellemzők, mint például a pKa, lipofilicitás és hERG-inhibíció értékek módot nyújtanak a kémikusoknak a vegyületek várható viselkedésének előrejelzésére biológiai közegben.
Vegyületek teljes tulajdonságprofiljának megjelenítése egyetlen összefoglaló táblázatban
A táblázatos megjelenítési mód kényelmes felületet biztosít az összes számítási eredmény egységes áttekintéséhez egyetlen képernyőfelületen. A program képes akár 1000 molekulát tartalmazó SD fájlok beolvasására is, és a vegyületekre vonatkozó számítások elvégzésére néhány egérkattintás segítségével. A táblázathoz saját adatok is csatolhatók, így minden, a munkafolyamatban szereplő adat egyetlen helyen tárolható és megtekinthető.
Szabadon megválasztható értékelési határértékek és színkódolás
Az eredmények vizuális kiértékelését nagyon egyszerűvé teszi, hogy minden kiszámolt molekulatulajdonság esetében megadható az elfogadhatóság alsó és felső határértéke, s a megadott intervallumon belül és kívül eső értékek saját választású színekkel jelezhetők. Így még nagy elemszámú molekulahalmazok jellemzése és leírása is könnyen kezelhető feladattá válik.
Számos eszköz segíti a döntéshozatali folyamatot
Az értékes információk kinyerését a számítási eredményekből, és a helyes következtetések levonását számos célzottan erre kifejlesztett eszköz segíti az ACD/Labs Percepta Profilers moduljaiban. Segítségükkel a vizsgálatba bevont molekulák sorrendbe állíthatók, rangsorolhatók és szűrhetők, a felhasználó által megadott feltételeknek megfelelően.
A program által nyújtott előnyök
- Igen sok molekulát tartalmazó vegyületkönyvtárakban is gyorsan azonosíthatók az ígéretes gyógyszermolekula-jelöltek, amelyek megfelelnek a kutatók által felállított fizikai-kémiai, ADME-, vagy toxicitási kritériumoknak.
- Jelentősen megnövelhető a kutató-fejlesztő munka hatékonysága.
- A megbízható molekulaprofilok alapján meghatározható a későbbiekben elvégzendő munkafeladatok legcélszerűbb sorrendje, és ésszerűen csoportosíthatók a rendelkezésre álló erőforrások.
- Az ACD/Labs Percepta Profilers moduljai két programcsomagban vásárolhatók meg. A számításokat végző algoritmusok ugyanazokat a színvonalas predikciós eszközöket használják, amelyeket az ACD/Labs fejlesztett ki tizenöt év kitartó munkájával, és amiket világszerte elismeréssel említenek, és elégedetten használnak kutatók, gyakorló kémikusok és szakértők.
ACD/PhysChem Profilers
A vegyületek fizikai-kémiai tulajdonságaik alapján jellemezhetők és szűrhetők, s a számszerű eredmények táblázatos formában foglalhatók össze. A tulajdonságokra megfelelőségi határértékek határozhatók meg, s színkódolás segítségével a molekulák osztályokba sorolhatók annak megfelelően, hogy eleget tesznek-e a megfelelőségi feltételeknek. Ily módon gyorsan áttekinthető, hogy a vizsgált vegyületek közül melyek rendelkeznek a kívánatos fizikai-kémiai értékekkel. A táblázatba épített, könnyen kezelhető szűrőeszközökkel egyszerű a vegyületek csoportosítása és kiválasztása.
A fontosabb kiszámítható fizikai-kémiai jellemzők:
- LogP (Oktanol-víz megoszlási állandó semleges anyagok széles körére, sztenderd körülmények között, 25 C-on.)
A modulról további részleteket talál a ACD/LogP Predictor leírásában.
- LogD (Megoszlási állandó különböző pH-értékeknél, ionpár-szétválasztással vagy anélkül: 1,7 (gyomor), 4,6 (nyombél), 6,5 (éhbél), 7,4 (vér), 8,0 (vastagbél).)
A modulról további részleteket talál a ACD/logD Predictor leírásában.
- pKa (Sav-bázis ionizációs állandó pontos kiszámítása 25 C-on, vizes közegben szerves vegyületekre.)
A modulról további részleteket talál a ACD/pKa Predictor leírásában.
- Oldhatóság (pH-függő vízoldhatóság számítása, intrinsic oldhatóság és a vegyület oldhatósága tiszta (nem pufferelt) vízben 25 C-on.)
A modulról további részleteket talál az Vízoldhatóság modul leírásában.
Az ACD/Labs Percepta Profilers moduljaival meghatározható tulajdonságok teljes listája:
- Vízoldhatóság
- Abszorpciós együttható (Koc)
- Biokoncentrációs faktor
- Sűrűség
- Szabad elfordulást engedő kötések száma
- Hidrogénkötés-donorok és -akceptorok száma
- Törésmutató
- LogD
- LogP
- Mólrefraktivitás
- Molekulatérfogat
- Molekulasúly
- Parachor
- pKa
- Poláris felszín nagysága
- Polarizálhatóság
- Lipinsky-féle 5-ös szabály
- Felületi feszültség
A program által nyújtott előnyök
- Előre felbecsülhető a molekulák fizikai-kémiai tulajdonságprofilja, még azelőtt, hogy szintetizálná, vagy kereskedelmi úton vásárolna a vegyületekből.
- Képet ad az elektrolitok és nemelektrolitok viselkedéséről.
- Gyors és átfogó képet nyújt a vizsgált vegyületekről, hogy a kutatás a legcélszerűbb irányban legyen folytatható.
ACD/Drug Profilers
A vegyületek sokaságából az ADME- és toxicitási jellemzők alapján szűrhetők ki az ígéretes gyógyszermolekula-jelöltek. A program a számítások eredményét jól áttekinthető táblázatban foglalja össze, s színkódolással különbözteti meg a becsült értékeket aszerint, hogy a felhasználó által megadott határértékek között maradnak-e. Ez a színkódolási eljárás segít a legmegfelelőbb molekulák vizuális azonosításában. A táblázat kezelőfelületének részét képező szűrőkkel egyszerűen osztályozhatók és kiválaszthatók a további vizsgálatra javasolható szerkezetek.
A fontosabb kiszámítható ADME- és toxicitási jellemzők:
- P-gp specifikusság (A vegyületeket az alapján osztályozza, hogy szubsztrátjai, nem szubsztrátjai, inhibitorai vagy nem inhibitorai a P-glikoproteinnek.)
- Orális adagolhatóság (A vegyületek értékelésénél figyelembe vett szempontok: oldhatóság, savas stabilitás, passzív abszorpció, első lépéses metabolizmus, aktív transzport.)
- Passzív abszorpció (Megjósolja a lipofilicitás és az ionizációs állandó korlátozó hatását az alábbi esetekben:
- az emberi bélflórában elérhető maximális abszorpció;
- éhbél áteresztőképessége;
- Caco-2 áteresztőképessége;
- abszorpciós arány.)
- Átjutás a vér-agy gáton (Megbízható és könnyen értelmezhető becslést ad a molekula vér-agy gáton való átjutási képességére a logPS-állandó segítségével.)
- Eloszlás (Megadja a plazmafehérje kötött részét, a humán albuminszérumhoz való kötődés egyensúlyi állandóját és a vérplazmában feloldott anyag eloszlásának kimutatható térfogatát.)
- Citokróm P450 inhibíció (Kiszámítja, hogy mekkora a valószínűsége annak, hogy egy vegyület inhibitora lesz az öt fő gyógyszermetabolizáló-enzim – CYP3A4, CYP2D6, CYP2C9, CYP2C19 és CYp13A2 – valamelyikének.)
- hERG inhibícó (Értékeli a molekula és a hERG csatorna kölcsönhatásából származó kardiotoxicitást.)
- Genotoxiciás (Kiszámítja annak a valószínűségét, hogy a vegyület pozitív AMES-tesztet ad.)
- Metabolikus stabilitás
- Absolv (Abraham-féle szolvatációs paraméterek)
A program által nyújtott előnyök
- Csökkenti a biológiai tesztelésen be nem váló molekulák arányát a vegyületek ADME- és toxicitási tulajdonságprofiljának tesztelés előtti, in silico meghatározásával.
- A kutatási erőforrások azokra a vezérmolekulákra összpontosíthatók, amelyek tulajdonságai eleget tesznek az adott feladat által támasztott egyedi követelményeknek.
- Csökkenti a drága és laboratóriumi munkát igénylő próbák szükségességét.
- Lehetővé teszi a kutatóknak a gyors és hatékony döntéshozatalt a gyógyszermolekula-jelöltek kiválasztásánál.